Cette page liste les modules installés sur le cluster. Des exemples de jobs et des informations détaillées sont disponibles pour certains modules en cliquant sur leur nom.
Si vous avez déjà accès à Azzurra, vous pouvez utiliser la commande module spider pour afficher la liste des modules.
Si vous avez besoin de comprendre comment utiliser des modules, veuillez cliquer ici.
Logiciel Version(s) URL amber 18, 20 (serial, mpi, cuda, cuda mpi) https://ambermd.org/ autodock 4.2.6 https://autodock.scripps.edu autodock-vina 1.1.2 http://vina.scripps.edu/ autotools basilisk http://basilisk.fr/ bcftools 1.3.1 http://www.htslib.org/ blas 3.8.0 http://www.netlib.org/blas/ clustershell 1.8.2 cmake 3.15, 3.17.3, 3.20.1, 3.30.3 https://cmake.org/ cuda 9.0, 9.2, 10.2, 11.0, 11.4, 12.2 https://developer.nvidia.com/cuda-zone dorado 0.5.3 https://github.com/nanoporetech/dorado ffmpeg 4.2 https://www.ffmpeg.org/ fftw 2.1.5, 3.3.8, 3.3.9, 3.3.10 http://www.fftw.org/ fluidity https://fluidityproject.github.io/ freefem 4.9 https://freefem.org/ gatk 4.1.5.0 https://gatk.broadinstitute.org/ gaussian 16 https://gaussian.com/ gaussview 6.1.1 https://gaussian.com/gaussview6/ gcc 4.8.5, 4.9.2, 9.3.0, 11.3.0, 12.2.0, 14.2.0 https://gcc.gnu.org/ gemini 0.30.2 https://gemini.readthedocs.io gmp 5.0.1 https://gmplib.org/ gnu 5.4.0, 7.3.0, 8.3.0 https://gcc.gnu.org/ gromacs 2022, 2021.4, 2021, 2018.8 avec plumed 2.5 http://www.gromacs.org/ gsl 2.6 https://www.gnu.org/software/gsl/ guile 3.0.7 https://www.gnu.org/software/guile/ hdf5 1.8.14, 1.10.5, 1.12.1, 1.14.0 https://www.hdfgroup.org/solutions/hdf5/ instagraal 0.1.2 https://github.com/koszullab/instagraal intel 2020-cluster-xe Site web Intel intel-runtime 2019 julia 1.9.0 https://julialang.org/ kmer-ssr https://github.com/ridgelab/Kmer-SSR lapack 3.9.0 http://www.netlib.org/lapack/ miniconda 3 https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html mpc 0.8.1 mpfr 2.4.2 https://www.mpfr.org/ mpich 3.3.1 https://www.mpich.org/ mvapich 2.3.2, 2.3.3 https://mvapich.cse.ohio-state.edu/ netcdf 4.7.1 https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/ netcdf-cxx 4.3.1 https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/ numeca 7.2.1 NumPy 1.15.3 https://numpy.org/ openbabel 2.4.1 http://openbabel.org/ openblas 0.3.7 https://www.openblas.net/ OpenFOAM.com 1912, 2006, 2206 https://www.openfoam.com/ OpenFOAM.org 5.0 https://www.openfoam.org openmpi 4.1.2, 4.1.4rc1 https://www.open-mpi.org/ paraview 5.10.1 https://www.paraview.org/ PETSc 3.16.2 https://petsc.org plumed 2.5, 2.6 ht tps://www.plumed.org/ pmix 2.2.2 https://pmix.org/ pnetcdf 1.12 https://parallel-netcdf.github.io/ povray 3.8 http://www.povray.org prun 1.3 Python 3.6.5, 3.7.7, 3.8.1, 3.9.6, 3.10.4 http://www.python.org/ R 3.6.1, 4.2.0 https://www.r-project.org/ RStudio 2022.02.2 https://rstudio.com/ samtools 1.3.1 http://www.htslib.org/ scalapack 2.0.2 http://www.netlib.org/scalapack/ scipy 1.2.1 https://www.scipy.org/ strelka 2.9.10 https://github.com/Illumina/strel ka Telemac v8p4r0 http://opentelemac.org travis http://www.travis-analyzer.de/ VarSCAN 2.3.9 http://varscan.sourceforge.net/ VASP 5.4.4 https://www.vasp.at/ VEP 99.2 https://www.ensembl.org/vep VMD 1.9.4 https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
