Liste des modules et logiciels

Cette page liste les modules installés sur le cluster. Des exemples de jobs et des informations détaillées sont disponibles pour certains modules en cliquant sur leur nom.

Si vous avez déjà accès à Azzurra, vous pouvez utiliser la commande module spider pour afficher la liste des modules.

Si vous avez besoin de comprendre comment utiliser des modules, veuillez cliquer ici.

LogicielVersion(s)URL
amber18, 20 (serial, mpi, cuda, cuda mpi)https://ambermd.org/
autodock4.2.6https://autodock.scripps.edu
autodock-vina1.1.2http://vina.scripps.edu/
autotools
basilisk http://basilisk.fr/
bcftools1.3.1 http://www.htslib.org/
blas3.8.0 http://www.netlib.org/blas/
clustershell 1.8.2
cmake3.15, 3.17.3, 3.20.1https://cmake.org/
cuda9.0, 9.2, 10.2, 11.0https://developer.nvidia.com/cuda-zone
ffmpeg4.2https://www.ffmpeg.org/
fftw2.1.5, 3.3.8, 3.3.9http://www.fftw.org/
fluidityhttps://fluidityproject.github.io/
freefem4.9https://freefem.org/
gatk4.1.5.0https://gatk.broadinstitute.org/
gaussian16https://gaussian.com/
gaussview6.1.1https://gaussian.com/gaussview6/
gcc4.8.5, 4.9.2, 9.3.0, 11.3.0, 12.2.0 https://gcc.gnu.org/
gemini0.30.2https://gemini.readthedocs.io
gmp5.0.1https://gmplib.org/
gnu5.4.0, 7.3.0, 8.3.0https://gcc.gnu.org/
gromacs2022, 2021.4, 2018.8 avec plumed 2.5http://www.gromacs.org/
gsl2.6https://www.gnu.org/software/gsl/
guile3.0.7https://www.gnu.org/software/guile/
hdf51.10.5https://www.hdfgroup.org/solutions/hdf5/
instagraal0.1.2https://github.com/koszullab/instagraal
intel2020-cluster-xeSite web Intel
intel-runtime2019
lapack3.9.0http://www.netlib.org/lapack/
miniconda3https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html
mpc0.8.1
mpfr2.4.2https://www.mpfr.org/
mpich3.3.1https://www.mpich.org/
mvapich2.3.2, 2.3.3https://mvapich.cse.ohio-state.edu/
netcdf4.7.1https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/
netcdf-cxx4.3.1https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/
numeca7.2.1
NumPy1.15.3https://numpy.org/
openbabel2.4.1http://openbabel.org/
openblas0.3.7https://www.openblas.net/
OpenFOAM.com1912, 2006, 2206https://www.openfoam.com/
OpenFOAM.org5.0https://www.openfoam.org
openmpi4.1.2, 4.1.5a1https://www.open-mpi.org/
paraview5.10.1https://www.paraview.org/
PETSc3.16.2https://petsc.org
plumed2.5, 2.6 https://www.plumed.org/
pmix2.2.2https://pmix.org/
pnetcdf1.12https://parallel-netcdf.github.io/
povray3.8http://www.povray.org
prun1.3
Python3.6.5, 3.7.7, 3.8.1, 3.9.6, 3.10.4http://www.python.org/
R3.6.1, 4.2.0https://www.r-project.org/
RStudio2022.02.2https://rstudio.com/
samtools1.3.1http://www.htslib.org/
scalapack2.0.2http://www.netlib.org/scalapack/
scipy1.2.1https://www.scipy.org/
strelka2.9.10https://github.com/Illumina/strelka
Telemactrunkhttp://opentelemac.org
travishttp://www.travis-analyzer.de/
VarSCAN2.3.9http://varscan.sourceforge.net/
VASP5.4.4https://www.vasp.at/
VEP99.2https://www.ensembl.org/vep
VMD1.9.4https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/