Liste des modules et logiciels

Cette page liste les modules installés sur le cluster. Des exemples de jobs et des informations détaillées sont disponibles pour certains modules en cliquant sur leur nom.

Si vous avez déjà accès à Azzurra, vous pouvez utiliser la commande module spider pour afficher la liste des modules.

Si vous avez besoin de comprendre comment utiliser des modules, veuillez cliquer ici.

LogicielVersion(s)URL
amber18 (serial, mpi, cuda, cuda mpi)https://ambermd.org/
autodock-vina1.1.2http://vina.scripps.edu/
autotools
basilisk http://basilisk.fr/
bcftools1.3.1 http://www.htslib.org/
blas3.8.0 http://www.netlib.org/blas/
clustershell 1.8.2
cmake3.17.3https://cmake.org/
cuda9.2, 10.2https://developer.nvidia.com/cuda-zone
ffmpeg4.2https://www.ffmpeg.org/
gatk4.1.5.0https://gatk.broadinstitute.org/
gaussian16https://gaussian.com/
gcc4.8.5, 4.9.2, 9.3.0 https://gcc.gnu.org/
gemini0.30.2https://gemini.readthedocs.io
gnu5.4.0, 7.3.0, 8.3.0https://gcc.gnu.org/
gromacs2018.8 mpi avec plumed 2.5http://www.gromacs.org/
gsl2.6https://www.gnu.org/software/gsl/
hdf51.10.5https://www.hdfgroup.org/solutions/hdf5/
instagraal0.1.2https://github.com/koszullab/instagraal
intel2020-cluster-xeSite web Intel
intel-runtime2019
lapack3.9.0http://www.netlib.org/lapack/
miniconda3https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html
mpich3.3.1https://www.mpich.org/
mvapich2.3.2, 2.3.3https://mvapich.cse.ohio-state.edu/
netcdf4.7.1https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/
netcdf-cxx4.3.1https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/
numeca7.2.1
NumPy1.15.3https://numpy.org/
openbabel2.4.1http://openbabel.org/
openblas0.3.7https://www.openblas.net/
OpenFOAM.com1912, 2006https://www.openfoam.com/
OpenFOAM.org5.0https://www.openfoam.org
openmpi4.0.3https://www.open-mpi.org/
plumed2.5, 2.6 https://www.plumed.org/
pmix2.2.2https://pmix.org/
pnetcdf1.12https://parallel-netcdf.github.io/
prun1.3
Python3.8.1http://www.python.org/
R3.6.1https://www.r-project.org/
samtools1.3.1http://www.htslib.org/
scalapack2.0.2http://www.netlib.org/scalapack/
scipy1.2.1https://www.scipy.org/
strelka2.9.10https://github.com/Illumina/strelka
Telemactrunkhttp://opentelemac.org
VarSCAN2.3.9http://varscan.sourceforge.net/
VASP5.4.4https://www.vasp.at/
VEP99.2https://www.ensembl.org/vep